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Jul 11, 2023

Identificação e caracterização de um poliomavírus na raia espinhosa (Raja clavata)

Virology Journal volume 20, Artigo número: 190 (2023) Citar este artigo 70 Acessos 2 Detalhes da Altmetric Metrics Membros da família Polyomaviridae possuem um genoma circular de DNA de fita dupla que

Virology Journal volume 20, número do artigo: 190 (2023) Citar este artigo

70 acessos

2 Altmétrico

Detalhes das métricas

Os membros da família Polyomaviridae possuem um genoma circular de DNA de fita dupla que foi identificado em vários hospedeiros, desde mamíferos até aracnídeos. Aqui relatamos a identificação e análise de uma sequência completa do genoma de um novo poliomavírus, o poliomavírus Raja clavata (RcPyV1), de um peixe cartilaginoso, o patim espinhoso (Raja clavata). A sequência do genoma foi determinada utilizando uma abordagem metagenómica com o objectivo de fornecer dados virais de base em peixes cartilaginosos em diferentes ecossistemas. O genoma RcPyV1 (4.195 nucleotídeos) tinha organização típica de poliomavírus, incluindo antígenos precoces (T pequeno; T ​​grande) codificados em uma fita e proteínas virais tardias (VP1; VP2) na fita complementar. A análise filogenética de máxima verossimilhança do grande antígeno T revelou que o RcPyV1 se agrupa com um poliomavírus obtido de outro peixe cartilaginoso, o poliomavírus 1 do peixe-guitarra (GfPyV1). Estes dois compartilham ~ 56% de identidade aos pares nas sequências das proteínas LT e VP1. Estas análises apoiam a hipótese de que os peixes cartilaginosos possuem uma linhagem específica de poliomavírus.

A família Polyomaviridae é composta por pequenos vírus de DNA de fita dupla, sem envelope, com um genoma circular de aproximadamente 4.000 a 7.000 nucleotídeos (nts) de comprimento [1, 2]. Esses vírus exibem uma organização conservada com uma região inicial e uma região tardia separadas por uma região reguladora não codificante (NCRR) [3], que contém os promotores precoces e tardios e a origem de replicação. A região inicial codifica até cinco proteínas antigênicas tumorais não estruturais, que estão envolvidas na replicação viral e na oncogênese. As proteínas antigênicas tumorais grandes e pequenas (LT e sT, respectivamente) são universalmente expressas por poliomavírus [1, 3]. A LT é uma proteína multirreguladora necessária para o início da replicação viral e ativação do promotor da região tardia, mas também para a supressão do seu próprio promotor, regulando assim a expressão gênica precoce (revisado em [4]). A função precisa da proteína sT não é clara, mas foi sugerido que ela desempenha um papel na regulação do ciclo de replicação viral (revisado em [4]). A região tardia codifica as proteínas do capsídeo VP1, VP2 e VP3, que são importantes para a montagem do vírion e saída nuclear [2, 3]. Além disso, o poliomavírus símio vírus 40 (SV40) também produz uma proteína VP4 tardia [5]. As regiões iniciais e tardias dos genomas do poliomavírus (PyVs) podem codificar ainda formas de splicing alternativo das proteínas codificadas, como o quadro de leitura aberta do antígeno T grande alternativo (ALTO; [6] ou a agnoproteína [7]). A agnoproteína é uma proteína reguladora essencial para sustentar um ciclo de vida viral produtivo, estando envolvida na replicação do DNA viral, na transcrição viral, na maturação e na liberação do vírion (revisado em [4]). Foi demonstrado que a proteína ALTO é expressa, mas não é essencial, durante a replicação, provavelmente desempenhando um papel acessório [6]. Mais recentemente, a proteína DUO também foi identificada em diferentes poliomavírus (https://ccrod.cancer.gov/confluence/display/LCOTF/Polyomavirus), porém, não há estudos abordando sua função.

PyVs foram identificados em vários mamíferos [8,9,10,11], pássaros [12], peixes [13, 14] e artrópodes [15]. Em peixes, PyVs foram descritos em peixes perciformes, como o robalo (Centropristis striata) [16], a dourada (Sparus aurata) [17], o notothen de espinha afiada (Trematomus pennellii) e a esmeralda notothen (Trematomus bernacchii) [1, 14], mas também em táxons de peixes cartilaginosos, como o peixe-guitarra gigante (Rhynchobatus djiddensis) [1, 13]. Genomas virais quiméricos que codificam proteínas relacionadas aos PyVs foram relatados nas espécies de enguia Anguilla japonica e A. marmorata [18,19,20]. Os PyVs de peixes pertencem a pelo menos duas linhagens evolutivas distintas, uma compreendendo PyVs de peixes perciformes e a outra abrangendo PyVs de peixes cartilaginosos [14], que inclui apenas um único PyV detectado no peixe-guitarra gigante (GfPyV1; [13].